آزمون پذیرش رشتههای تخصصی سطح چهار فقه مقارن، کلام جدید و رشتههای تخصصی سطح سه تفسیر و علوم قرآن، علوم و معارف حدیث و فلسفه و کلام اسلامی از سوی مرکز تخصصی آخوند خراسانی برگزار می‌شود.
مرکز تخصصی آخوند خراسانی برای سال تحصیلی 1401، در رشتههای تخصصی سطح سه شامل تفسیر وعلوم قرآن، علوم و معارف حدیث، اخلاق و تربیت اسلامی، فلسفه و کلام اسلامی و کلام مقارن و سطح چهار شامل فقه مقارن و کلام جدید دانشجو می‌پذیرد.
مدرسه‌ی زمستانی کلام امامیه با موضوع «نظریه‌های شناخت خدا در اندیشه امامیه» توسط مرکز تخصصی آخوند خراسانی، به مدت دو روز برگزار شد.